Si usáis el W3 Total Cache como plugin de cache en vuestro wordpresss, observareis que al final de vuestro código fuente inserta un comentario html muy similar a este:

Para poder eliminar este comentario html que genera la función ob_callback del W3 Total Cache, debemos editar el archivo:
/wp-content/plugins/w3-total-cache/lib/W3/Plugin/TotalCache.php
Y buscar la siguiente línea (en mi caso en la línea 205) y comentarla de esta manera:

Por último necesitas volver a “vaciar el cache” para ver el resultado ya en tu código fuente.